日本被某超级大国占领后，“日本”两字被视为禁忌，从此被称为—— 第11区。“第11区”的居民则被称为——ELEVEN。在那里，由那个超级大国派来的统治官掌握着政治的命脉。统治官以皇帝的名义，统辖着一切。在那里，被剥夺的不仅仅是自治权，还有尊严。超级大国借助其强大的军事力量，将世界各地纷纷划为自己的地区。而他们强大的力量来源，就是被称为——NIGHTMARE FLAME的人型兵器。其出色的性能在巷战中获得了惊人的战果。正因如此，超级大国依靠NIGHTMARE FLAME部队的压倒性战斗力，称霸了整个世界。 然而，看似坚不可摧的超级大国的统治堡垒，其实已经出现了细微的裂痕。充满野心，为达目的不择手段的“黑色王子”ルルーシュ。充满正义感，为人正直、公平的“白色骑士”枢木朱雀。
远东的“第11区”，即将发生惊天动地的大事……